1、浙江省立农事试验场

     光绪三十四年（1908年）三月宪台饬藩司拨大洋二千元在艮山门外笕桥山茶花地方购民地四十亩五分八厘二丝，创办农事试验场。清末宣统三年（公元1911年）六月，劝业道员董元亮聘范运枢为场长。设场于杭州艮山门外笕桥镇泥桥头南，场地约24公顷，分设作物、畜牧、农业化学、蚕桑四科，内设蚕桑实验室、农事讲习所、气候观察站等机构，附设测候所、养成所等。

    2、浙江省农林专业改进机构

    1915年起，浙江省陆续成立了蚕桑、棉业、昆虫、稻麦、林业、园艺、家畜、土肥等农林专业改进机构。
    1930年起成立省建设厅农林局农林总场，直隶于建设厅，总揽各农林改进部门。1932年农林总场改组为农业改良总场。

    3、浙江省农业改进所

    1937年日寇侵华，因杭州沦陷，浙江省各农林改良机构东迁。1938年1月省稻麦改良场、省林场、 省茶叶改良场、省棉业改良场、省蚕桑改良场、省园艺改良场、省昆虫局、省蚕种监管所、省水利局、省家畜保育所等机构合并，成立浙江省农业改进所，隶属于省建设厅，掌管全省农业技术改进、水利改良和垦荒事宜，经费由省财政厅拨给。
    浙 江省农业改进所由莫定森任所长，下设农艺、森林、病虫害、畜牧兽医、推广、总务等六股，农田水利工程队及会计室，省园艺改良场改称黄 岩农业推广区，后增设13个县级中心农场、9个农业推广区以及稻麦、棉花、蚕种、种畜等试验场。
    1942年夏，日寇进犯浙南，省农改所首迁云和，再迁景宁避战，直到抗战胜利，回迁松阳，1946年迁回杭州。

    4、浙江省农业科学研究所

    新中国成立后，省政府浙江省农业改进所进行了整编。1951年1月改名为浙江省农业科学研究所（简称省 农科所），机构设4系1室5场，即农艺系、农艺化学系、植物病虫害系、畜牧兽医系、秘书室、稻麦场、萧山棉场、黄龙洞农场、黄岩园艺场、硖石种畜场，由过兴先担任所长。1958年底，机构设置改为9系1站3场（厂）。事业经费由省农林厅拨给，1958年改由省财政厅拨款。
    继1957年12月17日、1958年1月5日周恩来总理和毛泽东主席先后视察省农科所后，省委将省农科所定为省直属单位，并委任省委书记处书记李丰平同志兼任所长，批准省农科所建立党委。

    5、浙江省农业科学院

    1960年2月省农业科学研究所、省林业科学研究所、省淡水水产研究所、省海 洋水产研究所、中国农科院茶科所合并组成浙江省农业科学院（简称省农科院），并和浙江农业大学（简称浙江农大）合而为一，一套班子两块牌子，由李丰平兼任校（院）长。1962年林业科学研究所、淡水水产研究所、海洋水产研究所划出。1965年院校分开设置。
    1976年科研秩序重新得到整顿。1977年底由6个研究所发展为9个，保留 原来的作物、植物保护、土壤肥料、园艺、蚕桑、畜牧兽医6所，新设了水稻、农业微生物、原子能利用研究所。
    1978年7个地区农科所及东阳玉米研究所归我院领导，实行院与地方政府双重领导。
    1979年新设农业自然资源和农业区划研究所。
    1980年成立情报研究所。
    1984年建成农业部重点实验室――病毒实验室。
    1984年起实行党委领导下的院长负责制和院领导任期制。
    1993年成立省农业新品种引进开发中心。
    1994年建立食品加工研究所。
    1997年院改革试点方案通过并实施。
    1998年农产品质量标准研究所成立（食品研究所增挂），2000年转由植物保护研究所挂牌。
    1998年生物技术研究所成立（病毒室增挂）。
    1998年水稻研究所成立（作物研究所增挂），浙江辐照中心成立（原子 能利用研究所增挂），花卉研究中心成立（萧山棉麻研究所增挂）。
    2000年浙江亚热带作物研究所（温州）、浙江柑桔研究所（黄岩）由省 科技厅划归院管理。
    2001年蔬菜研究所成立。
    2002年农业部农产品质量监督检验测试中心成立。
    2002年院学科结构调整，院下设作物与核技术利用、蔬菜（含农业新品种引种中心）、园艺、畜牧兽医、蚕桑、植物保护与微生物、环境资源与土壤肥料、病毒学与生物技术、食品加工、农产品质量标准、农村发 展与信息、柑桔、亚热带作物、花卉、玉米等15个专业研究所。 
    2003年被列为纯公益类科研机构。
    2010年成立数字农业研究所。
    2018年成立农业装备研究所、浙江农艺师学院、浙江省农业农村规划研究院。

    目前，浙江省农业科学院为浙江省政府直属的规模最大、多学科、综合性纯公益类农业科研机构，下设畜牧兽医、作物与核技术利用、植物保护与微生物、农村发展、蔬菜、蚕桑、农产品质量标准、环境资源与土壤肥料、园艺、病毒学与生物技术、食品科学、数字农业、农业装备花卉、玉米、柑桔、亚热带作物等17个专业研究所，涵盖种子种苗、安全生产与生态、 加工保鲜、高新技术和农村发展等五大领域。建有“农产品质量安全省部共建国家重点实验室培育基地”、“观赏作物资源开发国家地方联合工程研究中心（浙江）”等2个国家级平台；“农业部农产品及转基因产品质量安全监督检验测试中心(杭州)”等26个部级平台；“浙江省植保生物技术重点实验室”等11个省级平台。